因溢流導致災情慘重，全台上萬名「超人」馳援，不過一名48歲來自桃園市蘆竹區的林姓志工，于災情發生次日，馬上從南崁區載運2台「小山貓」機具，與姪子一同南下花蓮光復鄉，投入救災行列。沒想到在清理過程中，林男左腳不慎遭不明物體刺傷，起初僅作簡單處理未多在意，直到第8天身體持續發燒、紅腫惡化，才趕赴醫院治療。雖一度病情穩定，但感染部位腫脹未消，後續轉送林口長庚醫院，仍因敗血癥不治身亡。

花蓮縣縣府與衛福部接獲消息表達深切哀悼，並表示林男在災後第一時間主動馳援，是「真正的英雄」，也提醒所有投入重建的人員，應同時注意自身健康與防護。

花蓮慈濟副院長張宇勳表示，位于災區的光復醫療站，自9月24日至10月6日短短13天內，已救治超過3,500人次，其中近半約1500例都是外科病患。醫療團隊指出，災區環境惡劣，長時間泡水、搬運廢棄物及接觸污泥，導致「開放性傷口」感染個案激增。

張宇勳表示，常見的傷口包括穿刺傷、割傷、雨鞋磨破皮等，若在高濕度、細菌滋生的環境下持續作業，感染風險極高。「每天都有志工帶著傷口前來，有些人腳腫仍堅持清掃家園，令人又敬佩又心疼。」醫師提醒，若出現紅腫、熱痛、滲液等癥狀，應儘速就醫，避免惡化為壞死性筋膜炎或敗血癥。

醫療站除提供破傷風疫苗與抗生素治療外，也加強防護教育。醫師呼籲志工與災民，應穿著防水手套、長靴與口罩，避免直接接觸污水與銳器；若有香港腳、皮膚炎或過敏性體質者，更須加強防護，避免長時間踩水作業。

疾病管制署（疾管署）指出，樺加沙颱風造成光復地區嚴重淹水，災後污泥、廢棄物尚未完全清除，加上近期仍有降雨，恐增加類鼻疽、鉤端螺旋體病及腸胃炎等傳染病風險。疾管署提醒，災區人員應落實「裝備保護、飲食保護、清潔保護」三大防疫原則。

疾管署也呼籲，清理時勿赤手赤腳或穿拖鞋，避免接觸污水與廢棄物；飲水與食物應煮沸再食用，並保持手部清潔。若出現發燒、肌肉痛、腹瀉或黃疸等癥狀，應立即就醫並主動說明接觸史。